Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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