Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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