Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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