Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF2Q9UNY4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF2Q9UNY4 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms