Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TM6SF1Q9BZW5 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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