Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms