Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SNX29Q8TEQ0 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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