Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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