Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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PTPRNQ16849 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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