Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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