Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms