Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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