Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TLR1Q15399 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms