Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NKX1-1Q15270 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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