Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3AQ14563 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms