Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms