Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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