Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GTF2H2Q13888 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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