Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms