Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
APOFQ13790 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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APOFQ13790 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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