Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EIF4EBP1Q13541 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms