Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRQ13535 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms