Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TCOF1Q13428 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
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TCOF1Q13428 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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