Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms