Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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