Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN3Q13064 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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