Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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PGGT1BP53609 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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