Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPREP23469 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPREP23469 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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