Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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