Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms