Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PHACTR1Q9C0D0 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PHACTR1Q9C0D0 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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