Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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