Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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