Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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