Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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