Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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