Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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