Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SEC23BQ15437 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23BQ15437 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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