Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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HERC3Q15034 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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