Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NCAPHQ15003 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NCAPHQ15003 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NCAPHQ15003 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NCAPHQ15003 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms