Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SCARF1Q14162 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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