Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SPIDRQ14159 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SPIDRQ14159 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms