Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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