Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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