Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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