Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SNTB1Q13884 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms