Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PEX6Q13608 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PEX6Q13608 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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