Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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