Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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