Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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